Beken

WSLのUbuntu 22.04 LTSで分子動力学シミュレーションのプログラム パッケージであるAmberTools22とAmber22をコンパイルしてみた。少し古いバージョンであるため、Ubuntu 22.04 LTSでコンパイルしてみたところ、conda、cuda toolkit、およびGNUコンパイラのバージョンでトラブルがあった。Ubuntu 24.04 LTSでコンパイルするのは大変そうである。

まずambermd.orgのインストラクションを参考に、必要なモジュールをインストールした。

johndoe@ubuntu:~$ sudo apt install -y cmake
johndoe@ubuntu:~$ sudo apt tcsh make gcc gfortran flex bison patch bc wget xorg-dev libz-dev libbz2-dev

工事中